يعمل المكتب الإقليمي بالتعاون الوثيق مع شركاء الأمم المتحدة في المنطقة، ومع منظمات المجتمع المدني والمؤسسات الوطنية لحقوق الإنسان، فضلاً عن المنظمات الإقليمية.

 وسيواصل المكتب سعيه إلى بناء قاعدة عالمية داعمة لحقوق الإنسان، من خلال توطيد الشراكات مع ائتلافات إقليمية ووطنية جديدة قادرة على أن تكون عوامل فعالة للتغيير، مثل الشباب، والنساء، وقادة المجتمعات المحلية والدينية.

 على الصعيد الإقليمي، وعملاً بقرارات الجمعية العامة بشأن التعاون مع الهيئات الإقليمية ومذكرات إعلان النوايا، يواصل المكتب الإقليمي تعاونه مع جامعة الدول العربية ومجلس التعاون الخليجي ومنظمة التعاون الإسلامي.  كما يتعاون المكتب على نحو وثيق مع الشبكة العربية للمؤسسات الوطنية لحقوق الإنسان، لتنظيم أنشطة لفائدة المؤسسات الوطنية المعنية بحقوق الإنسان والجمهور الأوسع نطاقاً في المنطقة.